Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms