Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms