Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC28Q86X40 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC28Q86X40 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms