Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms