Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP43Q70EL4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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USP43Q70EL4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP43Q70EL4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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