Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUSD1Q6UWL2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms