Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF7Q6Q0C0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms