Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED27Q6P2C8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED27Q6P2C8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms