Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRNP1Q6NT89 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms