Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT80Q6KB66 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms