Protein–RNA interactions for Protein: Q6IN84

MRM1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM1Q6IN84 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRM1Q6IN84 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRM1Q6IN84 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms