Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP188Q5SRE5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP188Q5SRE5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms