Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms