Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDCA8Q53HL2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms