Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms