Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A12Q504Y0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms