Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM259Q4ZIN3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms