Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTXN3Q4LDR2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms