Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWISTNBQ3B726 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms