Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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