Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC27Q2M243 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms