Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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LRRC36Q1X8D7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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LRRC36Q1X8D7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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LRRC36Q1X8D7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LRRC36Q1X8D7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRRC36Q1X8D7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms