Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRY1Q16526 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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