Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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SSX1Q16384 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SSX1Q16384 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SSX1Q16384 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SSX1Q16384 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SSX1Q16384 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX1Q16384 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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SSX1Q16384 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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