Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ETFDHQ16134 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ETFDHQ16134 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms