Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms