Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYTH1Q15438 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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