Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
R3HDM1Q15032 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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