Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COL19A1Q14993 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms