Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NFIXQ14938 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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