Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM25Q14258 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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