Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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COL4A6Q14031 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL4A6Q14031 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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