Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2H3Q13889 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms