Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOFQ13790 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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