Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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