Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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IRF5Q13568 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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IRF5Q13568 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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IRF5Q13568 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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IRF5Q13568 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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IRF5Q13568 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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