Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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TUBB3Q13509 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TUBB3Q13509 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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