Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP3B2Q13367 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP3B2Q13367 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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