Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENBP1Q13228 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms