Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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TRAF2Q12933 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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TRAF2Q12933 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF2Q12933 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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