Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPN13Q12923 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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