Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNTN1Q12860 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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