Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TROQ12816 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TROQ12816 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TROQ12816 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TROQ12816 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TROQ12816 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TROQ12816 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TROQ12816 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TROQ12816 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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