Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TWF1Q12792 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TWF1Q12792 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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TWF1Q12792 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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