Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TFF3Q07654 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TFF3Q07654 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms