Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBQ06643 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LTBQ06643 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms