Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN1Q04323 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms