Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ID3Q02535 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms