Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLTCQ00610 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms