Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms